魔法世界分裂加剧，格林德沃的势力渗透进各国魔法部。邓布利多交给纽特一只看似普通的嗅嗅，并要求他潜入纽蒙迦德城堡的副本，偷取格林德沃年轻时封印在一枚魔法泪晶中的“悔恨”。这滴悔恨是摧毁格林德沃永生契约的关键。纽特带着蒂娜和雅各布，走遍巴黎的地下墓穴、德国的黑森林，寻找能承载这种情感的稀有神奇动物“共情蛞蝓”。行动失败，纽特被捕。格林德沃向他展示了一段被篡改的历史：邓布利多也曾渴望权力。最终，纽特放出了箱子里所有的神奇动物制造混乱，嗅嗅在混乱中盗走了泪晶，但揭示的真相却让纽特开始怀疑这场战争的对错。
虽然片名延续系列，但故事内核更成人向。神奇动物的出场不再是单纯的卖萌，而是推动剧情的逻辑节点。对“正义”与“罪”的模糊处理很大胆，结尾的道德困境让整个系列走向了更深刻的道路。
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